Студенческие беспорядки сопровождались безобразными выходками по отношению и к университетской администрации, и к полиции, и к простым обывателям. До 40 % народников 70-х гг. вышли из студенческой среды. Среди подвергнутых уголовной репрессии народовольцев было 64 % студентов. Часть профессоров, особенно преподававших гуманитарные дисциплины, читали лекции не столько по своим предметам, сколько «на злобу дня», разжигая и без того бушующие страсти. Не существовало единых учебных программ – специалисты одного профиля, выпускавшиеся разными университетами, получали весьма отличающуюся друг от друга подготовку.

Преодолевая сопротивление либеральной оппозиции, Делянову и Толстому пришлось уступить по ряду позиций и самое главное – отказаться от предлагавшейся ими системы государственных экзаменов вне стен университета. Против основных положений проекта выступал Победоносцев, полагавший, что корень зла не в учреждениях, а в людях, которые не делают своего дела, как следует. Устав, утвержденный Александром III 15 августа 1884 г., ознаменовал крупную победу консервативных сил – университетская автономия была ликвидирована. Ранее выборные должности ректора, декана, профессора стали назначаемыми Вводилась должность инспектора, отвечавшего за поведение и нравственный облик учащихся.